Как да направим количествената оценка на биомаркери по-възпроизводима в дигиталната патология

Количествената оценка на тъканен биомаркер не е само задача за анализ на изображения. Отчетената стойност може да се влияе от обработката на тъканта, фиксацията, химията на оцветяването, подготовката на слайда, сканирането, управлението на цветовете, анотацията, праговете и статистическата единица на анализа. Възпроизводимостта започва с разглеждане на целия процес като обект на оценка.

Определете измерването преди изграждане на процеса

Опишете какво се измерва, къде се измерва и как се отчита резултатът. Процент положителни клетки, оценка на интензитета, непрекъснато оптично измерване и комбиниран резултат са различни величини. Определете типа проба, оцветяването, тъканния компартмент, единиците, праговете и начина за обработка на липсващ или неинтерпретируем материал преди началото на анализа.

Контролирайте преданалитичния и оцветяващия процес

Документирайте времето за фиксация, обработката, дебелината на среза, партидите реактиви, настройките на инструментите, възстановяването на антигена, контролите и оцветяващия цикъл. Когато е подходящо, включвайте положителни и отрицателни контроли. Стабилният процес за изображения не може да компенсира неконтролирани промени, въведени преди сканирането.

Разглеждайте сканирането като част от измерването

Записвайте модела на скенера, обектива, разделителната способност, файловия формат, компресията, поведението при фокус и обработката на цветовете. Тествайте представителни слайдове на скенерите и софтуерните версии, които са важни за предназначената среда. Ако измерването се променя след сканиране, нормализация на цветовете или преобразуване на изображението, промяната трябва да присъства в записа за валидация.

Измервайте съгласието и източниците на вариация

Използвайте статистически план, който съответства на типа измерване. Оценявайте повторяемостта в рамките на цикъл, възпроизводимостта между цикли, читатели, скенери и обекти, както и съгласието около клинично значими прагове. Отчитайте несигурността и разглеждайте несъгласуваните случаи, вместо да разчитате на една корелация или статистика за съгласие.

Количествената оценка на биомаркери може да подпомогне изследователска работа или клинично решение, но числовият резултат сам по себе си не е диагноза. Всяка клинична употреба изисква подходящо предназначение, преглед от квалифициран професионалист и приложимия процес за валидация и регулаторна оценка.